築城年代は定かではない。城主は信太氏で小田氏の家臣であった。

信太伊勢守は佐竹氏への内通を疑われ土浦城で謀殺され、木田余城は小田氏に接収された。その後、佐竹氏と小田氏によって木田余城の攻防が繰り広げられたが、天正6年(1578年)佐竹義重がこれを奪うと破却し廃城となった。?

木田余城は現在の常磐線が分断するように通り、周囲も田畑や住宅となっていて遺構はない。常磐線の東側に案内板が設置されており、そこから地下道を潜った先に石碑が建っている。

線路の反対側には信太範棟の墓がある。ところで、紀貫之は土佐日記を平安時代に書いている。この紀一族の後継に信太氏がある。木田余氏は紀氏からの流れである。こう繋がってくると歴史は面白いその流れを汲む木田余氏が額田に来ていたことになる。